Luottamushenkilö- ja hallinto-organisaatio
Ylintä päätäntävaltaa kunnassa käyttää valtuusto, johon kuntalaiset ovat äänestäneet 43 valtuutettua. Vuoden 2008 lopussa valitun valtuuston toimikausi kestää 2009-2012.
Valtuuston ensimmäisessä kokouksessa 26.1.2009 vahvistettiin luottamushenkilöorganisaatio.
Hallinto-organisaatio
Janakkalan hallinto-organisaatiota johtaa kunnanjohtaja Anna-Mari Ahonen. Kunnan toiminnot jakautuvat konsernipalveluihin sekä kolmeen toimialaan; perusturvan, sivistyksen ja tekniikan ja ympäristön toimialoihin, joita johtavat kunkin toimialan johtajat.